| No. | 作品名 | 発表年 | 出版社 | 備考 |
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| 1 | 黄金の灰 | 2001/03 2006/11 |
原書房 創元推理文庫 |
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| 2 | 贋作「坊っちゃん」殺人事件 | 2001/10 2005/03 2010/11 |
朝日新聞社 集英社文庫 角川文庫 |
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| 3 | 饗宴 ソクラテス最後の事件 | 2001/10 2007/01 2019/10 |
原書房 創元推理文庫 角川文庫 |
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| 4 | はじまりの島 | 2002/07 2006/09 2022/10 |
朝日新聞社 創元推理文庫 幻冬舎文庫 |
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| 5 | 新世界 | 2003/07 2006/10 |
新潮社 角川文庫 |
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| 6 | パルテノン アクロポリスを巡る三つの物語 | 2004/07 2010/10 |
実業之日本社 実業之日本社文庫 |
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| 7 | 聖フランシスコ・ザビエルの首 ザビエルの首 |
2004/10 2008/08 |
講談社ノベルス 講談社 |
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| 8 | 我輩はシャーロック・ホームズである | 2005/12 2009/09 |
小学館 角川文庫 |
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| 9 | トーキョー・プリズン | 2006/03 2009/01 |
角川書店 角川文庫 |
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| 10 | シートン「探偵」動物記 シートン探偵記 |
2006/05 2009/03 2015/07 |
光文社 光文社文庫 文春文庫 |
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| 11 | 百万のマルコ | 2007/03 2022/03 |
創元推理文庫 集英社文庫 |
短編集 |
| 12 | 漱石先生の事件簿 猫の巻 | 2007/04 2010/11 2018/10 |
理論社 角川文庫 角川つばさ文庫 |
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| 13 | ジョーカー・ゲーム | 2008/08 2011/06 |
角川書店 角川文庫 |
短編集 |
| 14 | 虎と月 | 2009/02 2014/01 |
理論社 文春文庫 |
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| 15 | ダブル・ジョーカー | 2009/08 2012/06 |
角川書店 角川文庫 |
短編集 |
| 16 | キング＆クイーン | 2010/05 2012/02 |
講談社 講談社文庫 |
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| 17 | 最初の哲学者 改題）ソクラテスの妻 |
2010/11 2014/12 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 18 | ロマンス | 2011/04 2013/11 |
文藝春秋 文春文庫 |
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| 19 | 怪 談 | 2011/12 2014/06 |
光文社 講談社文庫 |
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| 20 | パラダイス・ロスト | 2012/03 2013/06 |
角川書店 角川文庫 |
短編集 |
| 21 | 楽園の蝶 改題）幻影城市 |
2013/06 2018/10 |
講談社 講談社文庫 |
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| 22 | ナイト＆シャドウ | 2014/07 2015/06 |
講談社 講談社文庫 |
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| 23 | ラスト・ワルツ | 2015/01 2016/03 |
角川書店 角川文庫 |
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| 24 | 象は忘れない | 2016/02 2020/02 |
文藝春秋 文春文庫 |
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| 25 | 柳屋商店開店中 | 2016/08 | 原書房 | 短編・エッセイ |
| 26 | 風神雷神 雷の章・風の章 風神雷神 上下 |
2017/08 2021/03 |
講談社 講談社文庫 |
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| 27 | 二度読んだ本を三度読む | 2019/10 | 岩波新書 | |
| 28 | 太平洋食堂 | 2020/01 2023/02 |
小学館 小学館文庫 |
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| 29 | アンブレイカブル | 2021/01 2024/01 |
角川書店 角川文庫 |
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| 30 | ゴーストタウン 冥界のホームズ | 2021/07 | 角川文庫 | |
| 31 | 南風に乗る | 2023/03 | 小学館 | |
| 32 | パンとペンの事件簿 | 2024/11 | 幻冬舎 |