| No. | 作品名 | 発表年 | 出版社 | 備考 |
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| 1 | 六番目の小夜子 | 1992/07 1998/08 2001/02 |
新潮文庫 ファンタジーノベル 新潮社 新潮文庫 |
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| 2 | 球形の季節 | 1994/04 1999/02 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 3 | 不安な童話 | 1994/12 1999/04 |
ノン・ノベル 祥伝社文庫 |
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| 4 | 三月は深き紅の淵を | 1997/07 2001/07 |
講談社 講談社文庫 |
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| 5 | 光の帝国 | 1997/10 2000/09 |
集英社 集英社文庫 |
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| 6 | 象と耳鳴り | 1999/11 2003/02 |
祥伝社 祥伝社文庫 |
短編集 |
| 7 | 木曜組曲 | 1999/11 2002/09 2019/02 |
徳間書店 徳間文庫 徳間文庫（新装版） |
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| 8 | 月の裏側 | 2000/03 2002/08 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 9 | ネバーランド | 2000/07 2003/05 |
集英社 集英社文庫 |
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| 10 | 麦の海に沈む果実 | 2000/07 2004/01 |
講談社 講談社文庫 |
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| 11 | 上と外 @素晴らしき休日 A緑の底 B神々と死者の迷宮 上 C神々と死者の迷宮 下 D楔が抜ける時 Eみんなの国 @〜Eをまとめたもの |
2000/08 2000/10 2000/12 2001/02 2001/06 2001/08 2003/02 2007/10 |
幻冬舎文庫 幻冬舎文庫 幻冬舎文庫 幻冬舎文庫 幻冬舎文庫 幻冬舎文庫 幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 12 | puzzle | 2000/11 | 祥伝社文庫 | |
| 13 | ライオンハート | 2000/12 2004/02 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 14 | ＭＡＺＥ | 2001/02 2003/11 2015/04 |
双葉社 双葉文庫 双葉文庫（新装版） |
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| 15 | ドミノ | 2001/07 2004/01 |
角川書店 角川文庫 |
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| 16 | 黒と茶の幻想 | 2001/12 2006/04 |
講談社 講談社文庫 |
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| 17 | 図書室の海 | 2002/02 2005/07 |
新潮社 新潮文庫 |
短編集 |
| 18 | 刧尽童女 | 2002/04 2005/04 |
光文社 光文社文庫 |
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| 19 | ロミオとロミオは永遠に | 2002/10 2006/07 |
ハヤカワSF Jコレクション ハヤカワ文庫 |
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| 20 | ねじの回転 | 2002/12 2005/12 |
集英社 集英社文庫 |
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| 21 | 蛇行する川のほとり （１） （２） （３） （１）〜（３）をまとめたもの |
2002/12 2003/04 2003/08 2004/11 2007/06 2010/06 |
中央公論新社 中央公論新社 中央公論新社 中央公論新社 中公文庫 集英社文庫 |
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| 22 | まひるの月を追いかけて | 2003/09 2007/05 |
文藝春秋 文春文庫 |
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| 23 | クレオパトラの夢 | 2003/11 2006/12 2015/04 |
双葉社 双葉文庫 双葉文庫（新装版） |
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| 24 | 黄昏の百合の骨 | 2004/03 2007/04 |
講談社 講談社文庫 |
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| 25 | 禁じられた楽園 | 2004/04 2007/03 2020/03 |
徳間書店 徳間文庫 徳間文庫（新装版） |
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| 26 | Ｑ＆Ａ | 2004/06 2007/04 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 27 | 夜のピクニック | 2004/07 2006/09 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 28 | 夏の名残の薔薇 | 2004/09 2008/03 |
文藝春秋 文春文庫 |
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| 29 | ユージニア | 2005/02 2008/08 |
角川書店 角川文庫 |
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| 30 | 小説以外 | 2005/04 2008/06 |
新潮社 新潮文庫 |
エッセイ |
| 31 | 『恐怖の報酬』日記 | 2005/04 2008/05 |
講談社 講談社文庫 |
エッセイ |
| 32 | 蒲公英草紙 常野物語 | 2005/06 2008/05 |
集英社 集英社文庫 |
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| 33 | ネクロポリス | 2005/10 2009/01 |
朝日新聞社 朝日文庫 |
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| 34 | エンドゲーム 常野物語 | 2006/01 2009/05 |
集英社 集英社文庫 |
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| 35 | チョコレート・コスモス | 2006/03 2011/06 |
毎日新聞社 角川文庫 |
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| 36 | 中庭の出来事 | 2006/11 2009/08 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 37 | 読書会 | 2007/01 2010/10 |
徳間書店 徳間文庫 |
山田正紀：共著 対談集 |
| 38 | 朝日のようにさわやかに | 2007/03 2010/06 |
新潮社 新潮文庫 |
短編集 |
| 39 | 木洩れ日に泳ぐ魚 | 2007/07 2010/11 |
中央公論新社 文春文庫 |
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| 40 | いのちのパレード | 2007/12 2010/10 2023/10 |
実業之日本社 実業之日本社文庫 実業之日本社文庫（新装版） |
短編集 |
| 41 | 猫と針 | 2008/02 2011/02 |
新潮社 新潮文庫 |
戯曲 |
| 42 | 不連続の世界 | 2008/07 2011/10 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 43 | きのうの世界 | 2008/09 2011/08 |
講談社 講談社文庫 |
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| 44 | ブラザー・サン シスター・ムーン | 2009/01 2012/05 |
河出書房新社 河出文庫 |
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| 45 | 訪問者 | 2009/05 2012/04 |
祥伝社 祥伝社文庫 |
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| 46 | メガロマニア | 2009/05 2012/09 |
NHK出版 角川文庫 |
紀行エッセイ |
| 47 | 六月の夜と昼のあわひに | 2009/06 2012/09 |
朝日新聞社出版 朝日文庫 |
短編集 |
| 48 | 私の家では何もおこらない | 2010/01 2013/02 2016/11 |
メディアファクトリー MF文庫 角川文庫 |
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| 49 | 土曜日は灰色の馬 | 2010/08 2020/03 |
晶文社 ちくま文庫 |
エッセイ |
| 50 | 隅の風景 | 2011/05 2013/11 |
新潮社 新潮文庫 |
紀行集 |
| 51 | 夢 違 | 2011/11 2014/02 |
角川書店 角川文庫 |
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| 52 | 私と踊って | 2012/12 2015/05 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 53 | 夜の底は柔らかな幻 | 2013/01 2015/11 |
文藝春秋 文春文庫 |
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| 54 | 雪月花黙示録 | 2013/12 2016/02 |
角川書店 角川文庫 |
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| 55 | EPITAPH東京 | 2015/03 2018/04 |
朝日新聞出版 朝日文庫 |
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| 56 | ブラック・ベルベット | 2015/05 2018/06 |
双葉社 双葉文庫 |
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| 57 | 消 滅 | 2015/09 2019/01 |
中央公論新社 幻冬舎文庫 |
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| 58 | タマゴマジック | 2016/03 | 河北新報出版センター | |
| 59 | 蜜蜂と遠雷 | 2016/09 2019/04 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 60 | 七月に流れる花 | 2016/12 2018/09 |
講談社ミステリーランド 講談社タイガ |
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| 61 | 八月は冷たい城 | 2016/12 2018/10 |
講談社ミステリーランド 講談社タイガ |
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| 62 | 失われた地図 | 2017/02 2019/08 |
角川書店 角川文庫 |
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| 63 | 終りなき夜に生れつく | 2017/02 2020/01 |
文藝春秋 文春文庫 |
短編集 |
| 64 | 錆びた太陽 | 2017/03 2019/11 |
朝日新聞出版社 朝日文庫 |
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| 65 | おともだちできた？ | 2017/06 | 講談社 | ホラー絵本 絵：石井聖岳 |
| 66 | 祝祭と予感 | 2019/10 2022/04 |
幻冬舎 幻冬舎文庫 |
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| 67 | 歩道橋シネマ | 2019/11 2022/02 |
新潮社 新潮文庫 |
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| 68 | ドミノ in 上海 | 2020/02 2023/02 |
角川書店 角川文庫 |
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| 69 | 七月に流れる花／八月は冷たい城 | 2020/07 | 講談社文庫 | 60と61の合本 |
| 70 | スキマワラシ | 2020/08 2023/03 |
集英社 集英社文庫 |
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| 71 | 日曜日は青い蜥蜴 | 2020/11 | 筑摩書房 | エッセイ |
| 72 | 現代マンガ選集 少女たちの覚醒 | 2020/12 | ちくま文庫 | 編集 |
| 73 | 灰の劇場 | 2021/02 2024/02 |
河出書房新社 河出文庫 |
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| 74 | 薔薇のなかの蛇 | 2021/05 2023/05 |
講談社 講談社文庫 |
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| 75 | 愚かな薔薇 | 2021/12 | 徳間書店 | |
| 76 | 月曜日は水玉の犬 | 2022/03 | 筑摩書房 | エッセイ |
| 77 | なんとかしなくちゃ。青雲編 | 2022/11 | 文藝春秋 | |
| 78 | 鈍色幻視行 | 2023/05 | 集英社 | |
| 79 | 夜果つるところ | 2023/06 | 集英社 | |
| 80 | 夜明けの花園 | 2024/01 | 講談社 | |
| 81 | spring | 2024/03 | 筑摩書房 |